В статье предложен инструментарий оценки финансовых рисков, которые возникают при недофинансировании программных диверсификационных мероприятий, реализуемых предприятиями оборонно-промышленного комплекса. Исследованы методологические подходы к управлению данными рисками при реализации указанных программ. Предложены экономико-математические модели анализа прогнозируемых финансовых результатов реализации программы диверсификации производства при недофинансировании ее мероприятий. При решении данной задачи использованы методы экономического анализа и экономико-математического моделирования. Разработанный инструментарий необходим для внесения корректировок и уточнения управленческих решений, регулирующих реализацию программы диверсификации производства. Реализация разработанного инструментария на практике позволит повысить эффективность диверсификационной деятельности предприятий оборонно-промышленного комплекса.