В статье рассмотрена роль дискриминантных моделей для краткосрочного прогнозирования несостоятельности организаций, отражены сложности их применения с учетом особенностей российской аграрной экономики. Апробировано применение зарубежных и отечественных дискриминантных моделей в практике финансового менеджмента аграрной организации. Выявлены недостатки данного метода, связанные с неполной информативностью включаемых показателей, временными ограничениями построения и интерпретации MDA-моделей. Показана целесообразность комплексного применения различных моделей дискриминатного анализа для оценки риска банкротства, исключающего зависимость результатов от методических подходов. Сделан вывод о рекомендательном характере применения MDA-моделей на уровне отдельной аграрной организации, заключающемся в совместном использовании альтернативных методов финансового анализа.